Последним местом службы стало Добровольное общество содействия армии, авиации и флоту Санкт-Петербурга, где он обучал молодых пилотов лётному делу. На момент начала СВО Канамату Боташеву было 62 года, но, несмотря на возраст, он принял решение вернуться в военную авиацию. За месяц боевых действий на его счету: 35 боевых вылетов, 160 поражённых военных целей, уничтоженная бронетехника и живая сила противника.
22 мая 2022 года штурмовик Су-25, пилотируемый Канаматом, выполнял боевое задание в районе города Попасная и принял сигнал о помощи от штурмовой группы российских военнослужащих, попавших в «огненный мешок». Несмотря на мощную вражескую оборону, лётчику удалось купировать атаку противника и обеспечить выход российских подразделений, однако «крылатая машина» Канамата была сбита ракетой, сам лётчик катапультироваться не успел.
За самоотверженность, героизм, доблесть и высокий профессионализм, проявленные в бою, генерал-майор запаса Канамат Боташев удостоен звания Герой Российской Федерации. 

После торжественной церемонии возложения гости приняли участие в Уроке мужества, в формате которого  школьникам рассказывали о том, что героем можно стать не только на поле боя, но и в повседневной гражданской жизни, защищая права и свободы сограждан. Был сделан акцент на том, что мужество проявляется не только в великих делах, но и в неприметных, на первый взгляд, поступках, на которых может держаться дружба, взаимовыручка, понимание и поддержка. Человечность, проявленная в различных обстоятельствах, была определена одной из главных ценностей в социуме. На мероприятии призвали хранить память о тех, кто, защищая своё Отечество, проявляя мужество и верность Родине.